Viyana Üniversitesi'ne bağlı olarak 1365 yılında kurulmuş olup, kuruluşundan bu yana tanınmış bir çok tipçinin eğitim verdiği önemli bir kurum olarak günümüze kadar varlığını sürdürmüştür.
Avusturya'nın en büyük ve köklü hastanesi olan AKH (Allgemeine Krankenhaus) 'nin 1784 yılında hizmete açılmasıyla, tıp üniversitesi daha modern araştırma imkanlarına erişmiştir. Bir çok alanda gelişmeler kat eden üniversite, ''Göz Hastalıkları'', ''Kulak Burun Boğaz'' ve ''Deri Hastalıkları'' alanlarında 4 tane nobel ödülü kazanmıştır. Buna ek olarak ''Kalp Nakli'' alanında dünyaca ünlü bir başarısı mevcuttur.
Üniversite'de yaklaşık 10.000 öğrenci eğitim görmektedir. 2004 yılında Viyana Üniversitesi'nden ayrılarak özerk bir kurum olmuştur.